プロテオミクス（DIA法）【網羅的タンパク質解析】
最新の分析機器を使ったタンパク質の網羅解析、バイオマーカー探索のプロテオーム解析受託追加サービスをご提供いたします。
【タンパク質の網羅解析（比較定量）】は、バイオマーカーとなる候補・経路が決まっておらず、広く網羅的にタンパク質発現変動を解析したいというお客様にお勧めです。
（ターゲットタンパク質を絞って高感度・高再現性での定量分析をご希望の方は iMPAQT法のページへ）
概要
プロテオミクス技術は、質量分析装置の進歩とともに大きく発展してきました。特に近年の技術革新は目覚ましく、タンパク質の検出感度、同定数、定量の再現性も飛躍的に向上しています。
2010年頃から、ショットガン法（DDA：Data Dependent Acquisition）に代表されるノンターゲットプロテオミクスが広く普及しました。DDA法では、存在量の多いペプチドから順にMS/MS解析を行う「Top N法」により、多数のタンパク質の同定・相対定量を実施します。この手法は酵母など比較的プロテオームの複雑性が低い生物種では非常に有用でしたが、ヒトのように発現ダイナミックレンジが広く複雑な生物種では、低発現タンパク質の取りこぼしやサンプル間での欠損値の発生など、測定再現性に課題がありました。
近年、こうした課題を解決するアプローチとして、DIA（Data Independent Acquisition）法が確立され、次世代の標準技術として広く利用されています。DIA法では、存在量に依存せず、すべてのペプチドをMS/MS解析することで、従来技術よりも高感度で再現性の高いプロテオーム解析が可能です。ヒトの培養細胞を用いた場合、1回の測定で数千タンパク質以上、装置や条件によっては1万を超えるタンパク質を解析できます。
本ページでは、DIAプロテオーム解析サービスをご紹介いたします。
測定メニュー
● DIAによる高深度発現プロテオーム解析 （凍結細胞・組織や特殊な濃縮を必要としない試料）
● 血漿／血清 他 低侵襲検体を対象とするプロテオーム解析
● DIAによるゲル中タンパク質の高感度同定解析
● 翻訳後修飾を対象としたプロテオーム解析（翻訳後修飾部位の同定と相対定量解析）
● ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織からのタンパク質抽出→プロテオーム解析（※）
● 培養上清を対象とするプロテオーム解析
分析例
HEK293F細胞を用いたRNA-seqおよびプロテオミクス相互解析の結果、RNA-seqの結果検出された約12000遺伝子のうち、従来DDA技術では約3000タンパク質しか検出されなかったのに対して、高深度DIAプロテオミクスでは約8000種、70％ものカバー率を得ることが可能となりました。
DIAプロテオミクスを用いれば従来技術では検出できなかったキナーゼや転写因子なども検出できる可能性があります。
関連論文掲載情報
測定機器・施設
測定機器：Orbitrap Exploris 480（Thermo Fisher Scientific社）
Orbitrap Astral（Thermo Fisher Scientific社）
timsTOF HT (Bruker社）
実施施設：DIA分析は、かずさDNA研究所にて実施したします。
測定サンプル・調製方法
その他のサンプル詳細につきましてはお問い合わせください。
価格
ご依頼内容により変動いたします。
お問い合わせください。
納期
ご依頼内容により変動いたします。
お問い合わせください。
納品物
- MS測定データ (.rawファイル)
- タンパク質同定・相対定量解析データ（解析ソフトウェア DIA-NN で出力されるデータ）
- 観測されたタンパク質名（Excelファイル）
- タンパク質の定量値（Excelファイル）
以上をHDD、DVD-RまたはUSBメモリスティックに収納して納品いたします。
問い合わせ・ご依頼
分析・見積もりをご依頼の方はお問い合わせフォームより以下の情報をご連絡ください。
事前にWeb面談でのお打ち合わせも可能です。お気軽にお申し付けください。
＜サンプル情報＞
サンプルの生物種（例：ヒト・マウス等）
サンプルの種類（例：細胞、凍結組織、培養液等）
サンプルの状態（例：細胞凍結ペレット、凍結組織片、可溶化バッファーに溶解等）
サンプルのタンパク質濃度（分かる場合のみ）
サンプル数
＜ご希望の測定メニュー＞
ディープDIAプロテオーム解析
ウルトラディープDIAプロテオーム解析
血清/血漿プロテオーム解析
ゲル内タンパク質同定
リン酸化DIAプロテオーム解析
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織からのDIAプロテオーム解析
など
＜ご要望詳細＞